在中国科学院知识创新工程进入“创新跨越、持续发展”的新阶段的时候，化学研究所走过了五十年的历程，在各级领导的关怀和支持下，经过几代人的不懈努力，化学所顺应化学科学的发展规律，面向国家战略需求、面向世界科技前沿，在基础研究、高技术创新研究和高新技术产业化等方面，取得了一批重要的成果，为促进化学科学的发展，促进国家经济建设和国防建设，做出了重要贡献。
　　1、获奖
　　截止2008年12月，化学所共获得国家及省部级奖272项，其中包括国家自然科学二等奖13项，三等奖2项；国家发明金奖1项，三等奖9项，四等奖1项；国家科技进步特等奖3项，一等奖1项，二等奖1项，三等奖4项；国家星火三等奖1项；全国科学大会奖24项。
　　2、原始创新能力和技术创新能力明显提高
　　自1989年科技部统计论文开始，化学所论文发表及被引用数连续十多年名列全国科研机构前列，高水平论文的数量稳步增加，充分反映了化学所基础理论研究的雄厚实力。
　　知识创新工程以来，化学所在化学、材料领域国际最重要的期刊“美国化学会会志”、“德国应用化学”、“先进材料”上发表的高水平论文不断增长，表现了化学所原始创新能力的不断提高。2008年《先进材料》还为化学所出版了一期专刊，报道了化学所在化学与材料科学交叉领域的系列研究成果，这也是这家国际著名学术期刊首次为科研机构出版学术专辑，充分显示了化学所在中科院知识创新工程以来国际学术影响和学术地位的不断提升。　
　　在专利申请、授权方面，化学所连续十多年名列中科院京区单位前列，表现了化学所在技术创新方面的雄厚实力。